C类驾驶证扣9分后，可以通过以下步骤清零：

直接处理违章

携带相关证件（身份证、驾驶证、行驶证）到车管所或通过交管12123APP处理违章。

缴纳相应的罚款。

等待记分周期结束

记分会在记分周期结束后自动清零，恢复到12分。

建议

及时处理违章：避免违章累计超过12分，以免影响驾驶资格。

了解学法减分：如果需要，可以通过交管12123APP参加学法减分，抵消部分扣分。

这些步骤简单明了，按照这些方法操作，可以确保C类驾驶证扣9分后能够顺利清零。